Klubą 1892 m. kovo 15 d. įkūrė Dž. Holdingas. Įkūrėjas komandai norėjo duoti pavadinimą „Everton FC and Athletic Grounds, Ltd“ (str. Everton Athletic), tačiau Anglijos futbolo asociacija šio pavadinimo nepripažino, tad klubas gavo „Liverpool FC“ vardą.

Pirmąjį sezoną (1892-1893 m.) "Liverpool" komanda laimėjo Lankašyro lygą. Rungtynės su Higher Walton "Liverpool" laimėjo 8-0. Po metų pradėjo žaisti antrajame divizione, kur laimėjo pirmą vietą. Po nesėkmių serijos, 1953-1954 m. sezone Liverpool FC žaidė antrajame divizione. Dėl FA Taurės klubas pirmąkart žaidė 1914 m., bet finale pralaimėjo FC Burnley klubui.

1959 m. gruodį buvo paskirtas naujas vyr. treneris B. Šanklis, kuris visiškai pakeitė komandos sudėtį. Su juo komanda 1961-1962 m. sezone laimėjo antrajame divizione, o 1963-1964 m. po septyniolikos metų pertraukos laimėjo šalies čempionatą. Tokia pati sėkmė aplankė ir kitąmet. 1965–1966 m. iškovota pirmoji FA Taurė. 1972–1973 m. Liverpool laimėjo aštuntą titulą ir nugalėjo Borussia Mönchengladbach, buvo iškovota pirmoji Europos taurė - UEFA Taurė.

Po metų vietoje B. Šanklio komandai pradėjo vadovauti jo asistentas B. Peislis. 1975-1976 m. jo treniruojami "Liverpool" futbolininkai tapo lygos čempionais ir laimėjo UEFA Taurę. 1977 m. buvo laimėta aukščiausia lyga ir pirma UEFA Čempionų taurė, finale 3-1 nugalėjus Borussia Mönchengladbach. Antrą kartą buvo laimėta 1978 m. 1-0, laimėjus prieš belgų klubą Club Brugge KV. 1979 m. laimėtas čempionatas. Po metų vėl laimėtas čempionatas, o 1980-1981 m. Paryžiuje laimėta trečioji Čempionų taurė. Kitus dvejus metus klubas laimėjo lygą ir lygos taurę. Valdant B. Peirsliui klubas per 9 metus laimėjo 21 taurę. 1983 m. Paisley perleido Liverpool „vairą“ savo asistentui Dž. Faganui. 1983-1984 metų sezone valdant naujam treneriui, komanda tapo pirmuoju Anglijos klubu laimėjusiu tris svarbiausias taures: aukščiausiąją lygą, lygos taurę ir Čempionų taurę. 1985 m. Liverpool žaidė Čempionų taurės finale prieš Juventus FC. Prieš pat prasidedant rungtynėms įvyko baisi nelaimė. Briuselio Heysel stadione viena iš sienų neišlaikė didžiulės žmonių minios, griuvo ir nusinešė 39 žmonių gyvybes. Tą dieną Liverpool pralaimėjo Juventus klubui 0-1.

K. Dalglišas, buvęs Liverpool žaidėjas, 1985 m. tapo vyr. treneriu. Jis padėjo klubui laimėti tris aukščiausiosios lygos taures ir dvi FA Taures. 1989 m. rungtynėse prieš Nottingham Forest FC FA pusfinalyje vėl įvyko nelaimė (Hillsbrough nelaimė). Visiems norintiems įeiti į stadioną vadovybė paliko atvirus vartus. Po varžybų prasidėjus dideliai spūsčiai ir dėl metalinės tvoros žuvo 96 sirgaliai.

1991 m. buvęs Liverpool žaidėjas G. Sunesas tapo nauju vyr. treneriu, su kuriuo komanda laimėjo FA Taurę. Jo vadovaujamai komandai nepavyko laimėti jokių svarbesnių pergalių. 1994 m. R. Evensas pakeitė G. Sunesą, bet ir su nauju treneriu komanda nepakildavo aukščiau trečios vietos. 1995 m. komanda laimėjo tik lygos taurę, finale 2-1 nugalėjusi Bolton Wanderers FC.

Ž. Huljė, buvęs Prancūzijos rinktinės treneris, atėjo į Liverpool komandą 1998 metais. 1998-1999 metų sezone dirbo kartu su R. Evensu, bet prasidėjus nesutarimams pastarasis 1998 m. lapkritį paliko komandą. Ž. Huljė 2000-2001 sezonas buvo sėkmingiausias per pastaruosius kelis dešimtmečius: laimėta FA Taurė, Anglijos lygos taurė ir UEFA taurė. Tačiau 2004 m. jis paliko komandą užleisdamas vietą ispanui R. Benitesui. Vadovaujant ispanų treneriui komanda sezoną baigė pirmenybes 5-ojoje vietoje, bet buvo iškovota dramatiška UEFA Čempionų lygos taurė Stambule prieš AC Milan (pralaimint 0-3 po pirmojo kėlinio). 2007 m. vasario 6 d. klubo prezidentais tapo amerikiečių verslininkai George Gillett ir Tom Hicks.